Está dirigida por una Comisión Directiva y una Comisión Fiscal que son elegidas cada 2 años donde los socios ejercen su derecho  votar y a ser elegidos.

SUEM fue creada para  cumplir los siguientes fines:

1) Estimular la investigación en endocrinología, difundir los conocimientos de esta especialidad y fomentar el estudio de sus problemas asistenciales

2) Organizar periódicamente sesiones científicas.

3) Organizar Congresos, Mesas Redondas, Simposios y Conferencias sobre temas de la especialidad.

4) Organizar la publicación de los trabajos científicos presentados y aprobados por la Asociación.

5) Mantener vínculos y/o integrar organizaciones docentes, científicas o gremiales, nacionales, extranjeras, regionales o mundiales con fines similares a la presente.

6) Impulsar la acción de la Endocrinología en el campo sanitario, social y laboral.

7) Velar por los aspectos éticos en el ejercicio  de la medicina en general y específicamente en lo que atañe a la endocrinología.

Realiza además reuniones científicas ordinarias y reuniones del Interior.

Existen Sociedades de este carácter en otros países de Latinoamérica y del resto del mundo agrupadas en la Federación Panamericana de Endocrinologia ( FEPAEN) y  en la International Society of Endocrinology (ISE) de las que forma parte.